Сейчас трудно найти неавтоматизированный кондиционер. Автоматизация климатических систем контролирует каждый цикл работы - охлаждение, отопление, увлажнение. Кондиционеры могут быть запрограммированы на ежедневные или еженедельные сеансы, с указанием интервалов часов интенсивной эксплуатации, или полного их отключения. Существует также функция тихого режима для работы в ночное время с возможностью установки температуры, при которой устройство запускается и останавливается.

Кондиционер может работать в автоматическом режиме, при котором он будет выбирать наиболее оптимальную скорость вентилятора для достижения и затем поддержания необходимой температуры. Температура также может автоматически переключаться с функции нагрева на охлаждение. Эта опция может быть полезна, например, когда днем очень жарко, а ночью температура резко падает. Можно также выбрать экономный режим, при котором кондиционер будет выбирать оптимальное соотношение между комфортом и потреблением энергии.

Еще одной не менее интересной опцией является функция горячего старта. Это препятствует проникновению холодного воздуха, когда кондиционер начинает работать в режиме нагрева. Некоторые кондиционеры имеют автоматическую очистку фильтра, другие указывают на необходимость его замены или очистки, или пополнение запаса воды в увлажнителе или пустой поддон.

Автоматизированная система управления кондиционеров имеет функцию авто-перезапуска, причем в случае сбоя питания, кондиционер автоматически перезагружается. Автоматизированное закрытие жалюзи способствует тому, чтобы направлять поток воздуха, когда кондиционер выключен. Также есть возможность автоматически установить жалюзи в правильном положении, когда кондиционер начинает снова работать. В некоторых моделях можно запрограммировать угол наклона жалюзи в зависимости от скорости воздушного потока и режима работы (нагрев или охлаждение).